L’église paroissiale de San Juan Bautista se dresse sur une petite colline au cœur de Lezo.
Pendant de nombreuses années, cette église fut partagée entre les communes de Pasai Donibane et de Lezo. Lorsque les habitants de Pasaia obtinrent l’autorisation de fonder une nouvelle paroisse au milieu du XVIe siècle, ils entreprirent la construction de leur propre église. Cependant, faute de moyens, les travaux ne commencèrent qu’au début du XVIIe siècle.
La construction de l’église débuta au nord. Deux chapelles, aux arcs légèrement brisés, s’ouvrent sur ce côté. Selon l’acte de donation, le côté sud compte également deux chapelles. L’une d’elles, fermée par un arc en plein cintre, sert d’entrée à l’église. On ne peut affirmer que cette porte ait été construite selon le modèle initialement prévu pour l’église d’Usurbil, car ce modèle a disparu. Celle de Lezo est une petite chapelle, réduite à une simple voûte d’ogives.
L’église est spacieuse et possède une nef unique. À l’extérieur, l’édifice présente de grands linteaux, tandis qu’à l’intérieur, on découvre des pilastres prismatiques et une base triangulaire. Ces éléments sont formés par l’assemblage des consoles soutenant les différentes cannelures de la voûte. L’église est surmontée d’un transept du XVIe siècle. Les cannelures sont ondulées et les bases courbes. Certains transepts sont ornés de décorations particulières. Il s’agit du seul exemple de ce type dans tout le Guipuscoa.
L’église compte quatre travées : le chœur s’élève au-dessus de la première. Un bel escalier permet d’y accéder. Le retable principal, haut de quatre étages, est surmonté d’un calvaire.
À l’extérieur, l’édifice présente des caractéristiques gothiques, notamment les gargouilles et le portail ouest. Au-dessus de la porte, plus récente, on peut observer les points de départ de l’arc brisé le plus ancien. Une immense fenêtre gothique s’ouvre au-dessus du portail. Pour diffuser la lumière, on trouve un réseau de meneaux et deux meneaux. Au-dessus de la fenêtre, côté sud, une moulure orne l’arc brisé. Elle se termine par une lancette. On n’y trouve ni remplage ni meneau. La moulure est composée de boules décoratives sur l’un des côtés de la façade sud.
Les remparts extérieurs sont très visibles dans l’abside et confèrent à l’église l’aspect d’une forteresse.

